Samsunlu aileye mensup olan İlker Canikligil, 1972 yılında İstanbul’da doğdu. 1991 yılında Saint-Joseph Fransız Lisesi’nden mezun olduktan sonra, 1992 yılında Marmara Üniversitesi’nde Sinema ve Televizyon bölümüne kaydoldu. Üniversiteyi devam ettirirken, 1992 yılında Nöbetçi, 1994 yılında Ağaç ve 1995 yılında Uçmak İstiyorum adlı üç kısa film çekti. Üniversite eğitimini tamamlayarak reklam alanında çalışmaya başladı.
1999 yılında İstanbul Bilgi Üniversitesi’nde Sinema ve Televizyon bölümüne ders verme görevine başladı. 2005 yılında kurgucu Walter Murch’ün The Blink of An Eye (Göz Kırparken) adlı kitabını Türkçeye çevirdi. 2006 yılında akademiden istifa etti ve aynı yılın içinde Ecinniler adlı dizinin pilot bölümünü yönetti. Ayrıca, kurgusunu yaptığı Gen filmiyle 13. Altın Koza Sinema Şenliği’nde En İyi Kurgu ödülüne layık görüldü. 2007 yılında Dijital Görüntü ile Sinema adlı bir kitap yayımladı. 2006’dan bu yana reklam yönetmeni olarak çeşitli ajanslarda görev aldı. 2010-2014 yılları arasında Bahçeşehir Üniversitesi’nde Fotoğraf ve Görüntü bölümünde sinematografi dersleri verdi. 2014 yılında İstanbul Sinema Akademi’nde direktörlük eğitimi verme görevine başladı. 2019 yılında İstanbul Sinema Akademi’nden ayrıldı ve Youtube kanalı FluTV’de içerik üretmeye başladı. Sanatkarın eserleri online platformlarda satışa sunulmaktadır.
